16-19世紀發現更古老的版本，經文與「公認本」出現差異，以新約為明顯。這批經文被人使用來校對經文的準確性。稱為「校勘經文」，可惜，數量不多。新約聖經有七個古抄本，和合本稱它們為「古卷」其中三個最古老的：
1. 代號：✽(350 A.D.) 西乃抄本 ( Sinaiticus Codex)
2. 代號： B(350 A.D.) 梵諦岡抄本 ( Vaticanus Codex)
3. 代號： A(450 A.D.) 亞歷山大抄本 ( Alexandrianus Codex) ，400年要遲。
理論上，(1) 越多數量。(2) 越接近原本。兩者都也越能證明記錄的準確。而「公認本」在數量佔優，古卷「校勘本」在年期佔優。它們各有所勝，故此，「校勘本」不能取代「公認本」。
和合本翻譯之際，也需借助「校勘經文」作參考，但也不能捨棄「公認本」。編輯者把細字加「有古卷」云云，註在原來經節後，讓讀者可以多角度了解。
1966年出版的現代英文譯本並在1975譯成的現代中文譯本，明顯著重有別的版本，下列兩處是有落差的經文。
一段經文落差在約翰福音8章1-11節，現中在註釋：「有古卷沒有這一段，另有古卷把這段放在約翰福音21:24後，也有古卷放在路加福音21:38後，再有古卷放在約翰福音7:36之後。這一段不是有與無的問題，因為除了一本沒有，其餘的都有。只是應放在那裏？所以影响不大。
最大篇幅的落差是馬可福音16章，「現中」版本在第8節便停止。然後聲明：「有古卷沒有9-20節結尾」。第九節後成為補篇。再加另一個聲明：「另有古卷只有第九和十節的短結尾。」這問題就大，究竟原來的正本有沒有這段呢？
答案是：沒有
聖經基本問題